Fecha/hora: 01/06/2024 23:17:54

Biblioteca(s): | INIA Las Brujas.
Tipo de la producción científica: | Artículos en Revistas Indexadas Internacionales
Circulación/Nivel: | Internacional - --
Fecha corriente: | 13/03/2020
Fecha de la última actualización: | 13/03/2020
Autoria: | BRANDA, A.; NICOLINI, P.; FEDERICI, M.; LLAMBÍ, S.
Afiliación: | ANDREA BRANDA SICA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; PAULA NICOLINI, Universidad de La República, Centro Universitario de Tacuarembó, Instituto Superior de la Carne, Área Biología Molecular; MARIA TERESA FEDERICI RODRIGUEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SILVIA LLAMBÍ, Universidad de La República. Facultad de Veterinaria, Sección Genética.
Título: | Identification of Holstein cows carriers of complex vertebral malformation by high resolution melting curves (HRM). [Identificação de vacas holandesas portadoras da malformação vertebral complexa através de curvas de dissociação de alta resolução - HRM.]
Año de publicación: | 2019
Fuente/Imprenta: | Archives of Veterinary Science. 2019, Vol.24, Issue 4, p. 62-70. DOI: 10.5380/avs.v24i4.65494
ISSN: | 1517-784X
DOI: | 10.5380/avs.v24i4.65494
Idioma: | Inglés

Notas:

Article history: Recebido em 18 Março 2019 / Aprovado em 28 Agosto 2019.
Corresponding author: Andrea Branda - email: abranda@inia.org.uy

Contenido:

ABSTRACT.
The objective of this study was the optimization and implementation of a  reliable  and  economical  molecular  screening  method  for  the  detection  of  the mutant  allele  of  CVM  (complex  vertebral  malformation,  c.559G>T, SLC35A3)  by HRM  analysis,  as  well  as  analyzing  its  existence  in  a  representative  sample  of Holstein cows from the Milk Genomic DNA Bank of Uruguay. The optimization of the HRM  methodology  in  the RotorGene?  6000  equipment  (Corbett  Life  Science, Australia)  by  amplification  of  the  79  bp  PCR  products  clearly  differentiated  the  two genotypes: homozygous, wild type: GG; and heterozygous, carrier for the mutation CVM:  GT  (c.559G>T; SLC35A3).  In  the  analyzed  sample,    the  frequency  of  the mutant allele (T) for CVM was high (q= 0.032), with a prevalence of carrier cows of 6.45%. It is concluded that the PCR-HRM analysis is a fast, easily interpretable, low cost,  and  highly  accurate  technique  for  the  detection  of  this  mutation  in  Holstein cattle, which may be implemented in genetic selection programs.

RESUMO.
O  objetivo  deste  estudo  foi  otimizar  e  implementar  um  sistema  fiável  e econômico   para   a   detecção   molecular   do   alelo   mutante   CVM   (malformação vertebral  complexa;  c.559G>T; SLC35A3)  por  meio  da  análise  HRM,  assim  como analisar  sua  presença  em  uma  amostrarepresentativa  devacas  Holandesasdo Banco  de  ADN  do  Instituto  Nacional  de  Pesquisa  Agropecuária  de  Uruguai.  A otimização  da  metodologia  HRM  no  equipamento  RotorGene?6000  (Corbett  Life Science, Austrália) através da amplificação dos produtos de PCR de 79 pb permitiu diferenciar os dois genótipos: ohomozigoto de tipo salvagem (GG) e o heterozigoto que presenta a mutação CVM (GT). Verificou-se que a frequência do alelo mutante (T)  para  CVM  na  amostra  analisada  foi  alta,  de q=  0,032,  enquanto  que  a prevalência de vacas portadoras da mutação foi 6,45%. Concluiu-se que a análise por PCR-HRM é uma técnica rápida, facilmente interpretável, de baixo custo e alta precisão  para  a  detecção  dessa  mutação  no  gado  Holandês,  que  poderia  ser implementada em programas de seleção genética.

Palabras-Clave: | Curvas de dissociaçãode alta resolução; CVM; High-resolution dissociation curve.
Categoría del tema: | L10 Genética y mejoramiento animal

URL:

http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/14303/1/Branda-A.-2019.-Archives-of-Veterinary-Science.pdf
https://revistas.ufpr.br/veterinary/article/download/65494/40219

Registro original: | INIA Las Brujas (LB)
Ejemplares: | LB - (102222-1) - PXI - AP - DD - PP/Archives of Veterinary Science/2019 -  -  - DIS